Из рыб в озере обитает корюшка, камбала, кунджа, навага, налим, терпуг, селёдка, краснопёрка. Во время хода на нерест через озеро Буссе в пресноводные водоёмы мигрирует огромное количество тихоокеанских лососей — сима, горбуша, кета.
Лагуна Буссе является одним из трех мест на Дальнем Востоке России, где размещаются плантации анфельции — водоросли из которых вырабатывается агар-агар.